Nova študija shizofrenije se osredotoča na interakcije med beljakovinami in beljakovinami

Podobno kot ljudje se tudi o genu lahko veliko naučimo, če pogledamo podjetje, ki ga vodi, in opazujemo, kako se obnaša. V prizadevanju, da bi odkrili več namigov o razvoju shizofrenije, so raziskovalci na Medicinski fakulteti Univerze v Pittsburghu raziskali, kako proteini, ki jih tvorijo geni, povezani s shizofrenijo, medsebojno delujejo.

"Lahko ugotovimo, kaj lahko beljakovine naredijo, tako da preverimo podjetje, ki ga vzdržujemo," je dejala dr. Madhavi Ganapathiraju, docentka za biomedicinsko informatiko na Medicinski fakulteti Pitt.

»Če na primer vem, da imate veliko prijateljev, ki igrajo hokej, lahko to pomeni, da se tudi vi ukvarjate s hokejem. Podobno, če vidimo, da na primer neznana beljakovina sodeluje z več beljakovinami, ki sodelujejo v nevronski signalizaciji, obstaja velika verjetnost, da je neznana prav tako vključena v isto. "

V nedavni zgodovini so znanstveniki izvedli številne raziskave o povezavah genoma (GWAS), ki so uspešno identificirale genske različice, povezane z večjim tveganjem za shizofrenijo. Vendar pa je relativno malo znanega o beljakovinah, ki jih ti geni tvorijo, kaj počnejo in kako medsebojno delujejo, pravijo raziskovalci.

"Študije GWAS in druga raziskovalna prizadevanja so nam pokazala, kateri geni bi bili lahko pomembni pri shizofreniji," je dejal Ganapathiraju. »Kar smo storili, je naslednji korak. Poskušamo razumeti, kako so ti geni povezani med seboj, kar bi nam lahko pokazalo biološke poti, ki so pomembne za bolezen. "

Na kratko, vsak gen tvori beljakovine in ti proteini običajno medsebojno sodelujejo v biološkem procesu. Preučevanje, kako se te beljakovine obnašajo med seboj, lahko osvetli vlogo gena, ki še ni bil preučen, razkriva poti in biološke procese, povezane s shizofrenijo, pa tudi njihov odnos do drugih zapletenih bolezni.

Po razvoju in uporabi novega računskega modela, imenovanega High-Precision Protein Interaction Napoved (HiPPIP), so raziskovalci odkrili več kot 500 novih interakcij protein-protein (PPI), povezanih z geni, povezanimi s shizofrenijo.

Raziskovalci dodajajo, da čeprav so se geni, povezani s shizofrenijo, v preteklosti identificirani in prek GWAS malo prekrivali, je model pokazal, da imajo več kot 100 skupnih interakcij. Ugotovitve bi lahko privedle do boljšega razumevanja bioloških podlag te duševne bolezni in pokazale tudi pot zdravljenja.

Ugotovitve so objavljene na spletu v Ljubljani npj Shizofrenija, revija Nature Publishing Group.

Vir: Šole zdravstvenih ved Univerze v Pittsburghu