Računalniške igre Phylo napredujejo v zdravstvenih raziskavah

Inovativne raziskave, ki uporabljajo spletno video igro, povezujejo ljudi z računalniki, da bi izboljšali znanstveno znanje o genskih osnovah bolezni, kot so Alzheimerjeva bolezen, diabetes in rak.

Igro, imenovano Phylo, je leta 2010 razvil računalniški znanstvenik dr. Jérôme Waldispuhl z univerze McGill in sodelavec Mathieu Blanchette.

Phylo je zasnovan tako, da igralcem priložnostnih iger omogoča, da prispevajo k znanstvenim raziskavam z urejanjem več zaporedij barvnih blokov, ki predstavljajo človeško DNK. S preučevanjem podobnosti in razlik med temi zaporedji DNA lahko znanstveniki dobijo nov vpogled v različne genetsko utemeljene bolezni.

V zadnjem letu je 17.000 registriranih uporabnikov Phylo lahko preprosto igralo igro iz zabave ali se odločilo, da bo pomagalo pri dekodiranju določene genetske bolezni.

"Veliko ljudi je reklo, da so radi igrali igro, ki bi lahko pomagala izslediti izvor določene bolezni, kot je epilepsija," je dejal Waldispuhl.

"V zamisli o istočasnem igranju iger in prispevanju k znanosti je veliko navdušenja," se je strinjala Blanchette. "To je igra brez krivde; zdaj si lahko rečete, da ni samo zapravljen čas. "

Waldispuhl in njegovi učenci so prišli na idejo, da bi z video igrico rešili problem poravnave več zaporedij DNA, ker je to naloga, ki jo računalniki težko opravijo dobro.

»Obstajajo nekateri izračuni, da človeški možgani delajo bolj učinkovito kot kateri koli računalnik. Prepoznavanje in razvrščanje vizualnih vzorcev sodi v to kategorijo, «je pojasnil Waldispuhl.

»Računalniki najbolje obvladujejo velike količine neurejenih podatkov, toda tam, kjer potrebujemo visoko natančnost, potrebujemo ljudi. V tem primeru so genomi, ki jih analiziramo, računalniki že predhodno poravnali, vendar so nekateri deli napačno poravnani. Naš cilj je prepoznati te dele in nalogo njihovega usklajevanja spremeniti v uganko, ki jo bodo ljudje želeli rešiti. "

Od začetka igre novembra 2010 so raziskovalci prejeli več kot 350.000 rešitev za težave z zaporedjem poravnav.

»Phylo je prispeval k boljšemu razumevanju regulacije 521 genov, ki sodelujejo pri različnih boleznih. Prav tako potrjuje, da je težko računske težave vključiti v priložnostno igro, ki jo lahko ljudje igrajo brez kakršnega koli znanstvenega usposabljanja, «je dejal Waldispuhl.

»To, kar počnemo tukaj, se razlikuje od klasičnih pristopov državljanske znanosti. Računalnikov ne nadomeščamo z ljudmi in jih ne prosimo, naj tekmujejo s stroji. Sodelujejo. Sinergija ljudi in strojev pomaga rešiti enega temeljnih bioloških problemov. "

Vir: Univerza McGill