Twitter pomaga prepoznati nevarne interakcije z drogami

Nova programska oprema, ki pridobiva podatke na Twitterju, lahko prepozna potencialno nevarne interakcije z drogami in neželene učinke, še preden se pojavijo v tradicionalnih zbirkah podatkov.

Interdisciplinarni računalniški znanstveniki z univerze v Vermontu so ustvarili računalniški program, s katerim lahko na Twitterju učinkovito poiščejo imena številnih zdravil in zdravil - in ustvarijo zemljevid, kako so povezani - z uporabo #hashtagov, ki jih povezujejo.

Raziskovalci pravijo, da lahko programska oprema odkrije potencialno nevarne interakcije z zdravili in neznane neželene učinke, še preden se pojavijo v medicinskih bazah podatkov, kot je PubMed, ali celo preden zdravniki in raziskovalci sploh slišijo zanje.

"Naš novi algoritem je odličen način za odkritja, ki jih lahko spremljajo in preizkušajo strokovnjaki, kot so klinični raziskovalci in farmacevti," je povedal Ahmed Abdeen Hamed, računalniški znanstvenik z univerze v Vermontu, ki je vodil ustvarjanje novega orodja.

Poročilo o delovanju algoritma in njegovih predhodnih odkritjih je objavljeno v spletu v Časopis za biomedicinsko informatiko.

"Morda ne vemo, kakšna je interakcija, toda s tem pristopom lahko hitro najdemo jasne dokaze o zdravilih, ki so med seboj povezane prek hashtagov," je dejal Hamed.

Raziskovalci menijo, da bi lahko nov pristop uporabili tudi za ustvarjanje javnih opozoril, je dejal Hamed, preden se začne klinična preiskava ali preden zdravstveni delavci prejmejo posodobitve. "Lahko nam pove: morda tukaj vidimo interakcijo med zdravili," je dejal Hamed. "Pazite."

Preiskovalci prav tako verjamejo, da lahko metoda pomaga premagati dolgoletni problem v medicinskih raziskavah: objavljene študije prepogosto niso povezane z novimi znanstvenimi dognanji, ker digitalne knjižnice "redko označujejo". To pomeni, da je posodabljanje pomembnih digitalnih informacij, kot so ključne besede in metapodatki, povezani s študijami, mukotrpna ročna naloga, ki je pogosto zamujena ali nepopolna.

"Rudarske hashtagove na Twitterju nam lahko dajo povezavo med novimi znanstvenimi dokazi in PubMedom," je povedala Hamedova množična baza podatkov, ki jo vodi ameriška nacionalna medicinska knjižnica. Ekipa Vermonta je z njihovim novim algoritmom ustvarila spletno mesto, ki bo raziskovalcu omogočilo, da razišče povezave med iskalnimi izrazi (recimo "albuterol"), obstoječimi znanstvenimi študijami, indeksiranimi v PubMed - in hashtagi na Twitterju, povezanimi z izrazi in študijami.

Prejšnje študije so pokazale, da je Twitter mogoče izkopati zaradi slabih interakcij z drogami, toda ekipa iz Vermonta to idejo napreduje tako, da se osredotoči na značilne informacije, ki jih vsebujejo hashtagi - kot so "#overprescribed", "#kidneystoneprobs" in "#skinswelling". nova združenja.

"Vsak posamezni hashtag deluje skoraj kot nevron v človeških možganih in pošilja določen signal," pišejo znanstveniki, ki lahko razkrijejo presenetljivo pot med dvema ali več zdravili.

Pristop ekipe vključuje izgradnjo tistega, kar imenujejo "mreža K-H" - v bistvu gost zemljevid povezav med ključnimi besedami in hashtagi - in nato obrezovanje veliko "hrupa in smeti", pravi Hamed, "to je Twitter!" - najti izraze, ki so osrednjega pomena za omrežje. Nato algoritem, imenovan HashPairMiner, v tem očiščenem omrežju poišče najkrajše poti med parom iskalnih izrazov in njihovimi vmesnimi hashtagi.

Splošni cilj projekta, ki ga podpira Nacionalna znanstvena fundacija, je "odkriti kakršno koli povezavo med dvema zdraviloma, ki ni znana," je dejal Hamed. Toda "hipoteza, ki temelji na resnici" - da lahko rudarjenje podatkov v Twitterju najde neznane interakcije med zdravili - je ekipa želela dokazati, da lahko njihov pristop "ustvari že znane interakcije", pravi Tamer Fandy, profesor farmacevtskih znanosti na kampusu Albany College of Pharmacy v Vermontu in soavtor nove študije.

"Je," je rekel Hamed. V enem od primerov nove študije je algoritem zaznal pot med aspirinom in zdravilom za alergije benadril, za katere je znano, da medsebojno delujejo; v enem primeru sta bili dve zdravili - morda ne preveč presenetljivo - povezani s hashtagom »#happythanksgiving«.

Nov sistem se je začel s tem, kar je novembra 2013 univerza v Vermontu Hamed mislil kot napako. Prejšnja različica sedanjega algoritma je "odkrila nekaj šokantnega: ibuprofen in medicinska marihuana - za katere bi mislili, da nimajo nič skupnega - povezuje hashtag z imenom # Alzheimerjeva bolezen, «pravi Hamed.

»Mislil sem, da mora biti to napaka. Pogledal sem svojo kodo. Ponovil sem svoj poskus. Zbral sem različne podatkovne sklope tweetov - in dosegel sem enak rezultat, «je dejal. Vendar ni mogel najti nobene podpore za združenje v PubMedu ali drugih zbirkah podatkov klinične literature. Pravzaprav je edina študija, ki jo je našel od leta 1989, nakazovala nasprotno, da med ibuprofenom in marihuano ni bilo interakcije.

Izkazalo se je, da je Hamed nenamerno odkril ljudi v Twitterverseu, ki so delili rezultate povsem nove strokovno pregledane študije, ki kaže, da ima ibuprofen nekaj sposobnosti, da blokira ali zmanjša spomin škodljive učinke redne uporabe marihuane, kar je povezano z razvojem Alzheimerjeve bolezni. "Na Twitterju se je pojavil pred PubMedom," je dejal Hamed.

Ker več držav legalizira marihuano, je Hamed dejal, da se bo morda začelo vse več razpravljati o njenih interakcijah z drugimi drogami - pred sposobnostmi raziskovalcev za preučevanje teh interakcij.

"Če bomo lahko zaznali pomisleke - recimo klepetanje o glavobolih ali padcih krvnega tlaka ali kar koli drugega," je dejal, "to lahko farmacevte ali raziskovalce pripelje do hipoteze, ki ji lahko sledi klinično preskušanje ali drug zdravniški test. "

Vir: Univerza v Vermontu